紫番薯的贮藏方法同普通番薯没什么区别。番薯贮藏期间正值冬季，保持适温是安全贮藏的关键。目前，贮藏番薯普遍采用窖藏的方法。

    首先，选择避风向阳、地势高燥的斜坡或梯地，挖成洞口小、洞腹大，长和宽各1米、高0.8米的半圆形山洞窖。在梯地上挖窖，窖顶上端须留土l米以上，以防塌方。窖门位置要比石堆高，以便通风散热。入窖薯块以堆到窖高的二分之一至三分之二为宜。窖门一般可用竹帘或草片，待到寒潮来临前再用砖石或木板密封洞口，以利保温。

    其次，番薯入窖前要严格挑选，剔除破伤薯、病虫薯、裂薯及受冻薯等，在窖底和窖四周铺垫干草。番薯入窖后的20-30天内称发汗期，要以通风、降温、散湿为主，不要封闭窖门。待到窖外气温接近10℃时才可以封窖，使窖温稳定在12-14℃，相对湿度保持在80％左右。番薯入窖后的30-40天至翌年温度回升之前称越冬期，这段时间的管理工作要以保温防寒为中心。窖外须加厚土层，严封窖口；窖内要盖草保温，使窖温保持在12-14℃之间，防止雨雪渗入和老鼠为害。开春后气温回暖期，要及时通风换气，稳定窖温。在保持窖温12-14℃的前提下，减少覆盖，逐渐打开窖门，保持薯块正常呼吸。早春天气时冷时热，要随时做好番薯的保温和散热工作。